第107次尝试后,他们找到了细胞里的“癌症帮凶”
在每一个人的身体里,每天都有数万亿个细胞在安静地工作、分裂、死亡。维持这套系统精密运转的,是一套我们看不见也感觉不到的“指令系统”。而当这套指令的“剪辑”出现错误时,癌症、发育畸形、神经退行性疾病就可能接踵而至。
日前,西湖大学万蕊雪团队联合施一公团队在国际学术期刊《Vita》上发表了一项最新研究,他们首次解析了人源U12型剪接体在催化核心状态的高分辨率结构,并揭示了数个与肿瘤发生发展密切相关的关键蛋白。
值得注意的是,他们在“剪辑”现场,揪出了几个与癌症密切相关的“帮凶”。这不仅是结构生物学的一次突破,更有可能为未来的抗癌药物,打开一扇全新的大门。
而这一切的背后,是一段跨越六年、历经107次失败的真实故事。

论文截图
追踪一台看不见的“幽灵机器”
我们的生命密码(DNA)就像一本厚重的“人生指南”,但细胞在“阅读”时,并不会逐字逐句地念。因为这本书里充斥着大量“无用信息”(内含子),必须经过“剪辑”,再把有用的段落(外显子)无缝拼接,才能生成正确的“工作指令”(mRNA)。
负责这项“剪刀手”任务的,是一台名为“剪接体”的超级分子机器。而在庞大的剪接体家族中,有一支神出鬼没的“特种部队”——稀有的U12型剪接体。
为什么说它“稀有”?万蕊雪打了个形象的比方:如果说负责99%以上剪辑工作的主要剪接体,是城市主干道上川流不息的车流,那这支“特种部队”就是深夜里偶尔驶过的一辆自行车。
“一旦这台机器发生故障,后果往往是灾难性的,癌症、严重的生长发育缺陷、神经退行性疾病便会接踵而至。”万蕊雪解释道。
自20世纪90年代被发现以来,稀有剪接体已困扰了学界三十余年,因它在细胞内含量极低,像一台看不见的“幽灵机器”。
“它是RNA剪接机理方面,一个显著存在的未解之谜。”万蕊雪说。这是一个充满诱惑却又极具挑战的领域。作为刚刚独立的青年科学家,她的目标明确:不仅要看到它究竟“长什么样”,还要看清它究竟“怎么工作”。
2021年和2024年,万蕊雪团队与施一公团队合作,先后在《科学》杂志上发表了稀有剪接体在“准备开工”(激活态)和“刚组装好”(组装态)状态的结构。但这些状态,都只是“剪辑”开始前的准备工作。真正的核心——催化反应,即那把“剪刀”如何落下(催化态),依然是一个深不见底的黑箱。也是在这一步,万蕊雪发现,他们被难住了。

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107次“迭代”后的奇迹
要想看清“剪辑”过程,首先得让这台“幽灵机器”在工作时被“抓”住。
这几乎是个不可能完成的任务。它在细胞里的含量只有“主力部队”的1%左右,且极不稳定。想让它在体外“听话”地进入工作状态,曾是领域内无人敢轻言攻克的关卡。
科研团队设计了一种高效的“诱饵”(pre-mRNA)——一段需要稀有剪接体“剪辑”的特定素材,能够像钓鱼一样,特异性地从细胞提取物中“钓”出目标机器。
这更像一场漫长的“迭代游戏”。他们像一群精细的工匠,反复调整“诱饵”的设计:修核心序列、换外显子、加增强子……每一次调整,都只为让活性提升一点点。
测试、失败、再调整、再测试……这样的循环持续了整整三年。
“我们肯定是在不断地主动想办法,而不是中途放弃。”万蕊雪回忆,“每次活性提升了一点点,我们马上兴奋地去试新实验。”
终于,在第107次尝试时,奇迹发生了:经过特殊改造的“诱饵”,让稀有剪接体的体外工作效率提升了约100倍!这就好比原本一分钟只能剪辑1条素材,现在能剪100条。这一数量级的跨越,让捕捉“剪辑进行时”从不可能变成了可能。

科研团队合影 白蕊(左)与郭晗(右)
意外牵出的“癌症线索”
捕捉成功后,团队利用冷冻电镜技术,第一次让人类亲眼“看见”了稀有剪接体执行剪接反应的完整瞬间,并在高清结构下,看清了许多令人惊叹的细节。
真正的惊喜来自“合影”里出现的几个“无关人员”。在解析结构时,团队发现有几个从未见过的蛋白质,死死地“卡”在剪接体的关键位置上。顺着线索追查下去,他们发现,这些蛋白,竟然都与癌症密切相关。
比如MMTAG2,是一个在多发性骨髓瘤中异常活跃的蛋白。研究发现,它像一根“支柱”,撑住了剪接体的活性中心。这意味着,癌细胞可能正是在利用这根“支柱”来维持疯狂生长。
又或者WDR25和FAM204A,是剪接第二步反应的“稳定器”。过往数据显示,它们在多种癌症患者体内的含量,直接与患者的生存率挂钩。
虽然目前还不清楚这些蛋白是导致癌症的“元凶”,还是癌症带来的“帮凶”,但这项研究无疑为抗癌药物的开发提供了一批全新的潜在“靶点”。或许未来,我们可以通过干扰这些蛋白,来切断癌细胞赖以生存的剪接通路。
从“剪接体长什么样”到“它为什么要长这样”,万蕊雪的追问还在继续。对于这位年轻的科学家来说,解析结构只是揭开帷幕一角,更广阔的未知在于进化逻辑与疾病关联的深层拷问。而科学最迷人的地方,或许正是在于这种从分子机器的精密运转中,窥见生命与疾病隐秘关联的瞬间。
(西湖大学供图)